More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4550 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  51.2 
 
 
665 aa  702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  50.82 
 
 
671 aa  688    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  100 
 
 
659 aa  1345    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  58.17 
 
 
665 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  55.74 
 
 
661 aa  765    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  52.56 
 
 
664 aa  698    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  52.25 
 
 
668 aa  713    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
671 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  49.36 
 
 
653 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  45.57 
 
 
650 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  46.01 
 
 
637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  43.26 
 
 
642 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  42.99 
 
 
701 aa  468  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.89 
 
 
292 aa  283  9e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  49.35 
 
 
341 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.95 
 
 
295 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
305 aa  273  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  50.38 
 
 
295 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  48.79 
 
 
319 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  48.39 
 
 
294 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 
291 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 
291 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 
291 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
273 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
291 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
291 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 
291 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
294 aa  180  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
275 aa  179  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  46.05 
 
 
294 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
280 aa  173  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  30.87 
 
 
359 aa  166  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  31.75 
 
 
373 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  34.15 
 
 
358 aa  157  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  31.47 
 
 
354 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  31.11 
 
 
356 aa  150  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
383 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  32.31 
 
 
381 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  32.03 
 
 
383 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  27.76 
 
 
1270 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
290 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 
242 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 
242 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
264 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  33.82 
 
 
301 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
346 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
267 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
262 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  31.64 
 
 
410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  26.74 
 
 
392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
262 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
279 aa  115  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  29.15 
 
 
544 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.71 
 
 
937 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  30.86 
 
 
505 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  30.97 
 
 
506 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  32.17 
 
 
437 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.79 
 
 
347 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
254 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
241 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
260 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.23 
 
 
264 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.85 
 
 
264 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.85 
 
 
264 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.85 
 
 
264 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
249 aa  110  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.85 
 
 
264 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
258 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  28.85 
 
 
264 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 
256 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.85 
 
 
264 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
293 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
269 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
266 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
264 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
317 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
278 aa  107  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
277 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
258 aa  107  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 
334 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.41 
 
 
264 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
261 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
267 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
261 aa  105  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
253 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
272 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
366 aa  104  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.03 
 
 
264 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
258 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  26 
 
 
2439 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 
342 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
250 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
265 aa  104  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
295 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
252 aa  103  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
592 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
257 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
267 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
290 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>