More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3466 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  100 
 
 
294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  71.33 
 
 
291 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  71.68 
 
 
291 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  71.68 
 
 
291 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  64.98 
 
 
319 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  63.31 
 
 
294 aa  333  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  61.59 
 
 
291 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  61.59 
 
 
291 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  61.59 
 
 
291 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  63.08 
 
 
294 aa  330  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
275 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 
661 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 
671 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
665 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
292 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 
668 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
305 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.81 
 
 
295 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  43.24 
 
 
664 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  44.21 
 
 
665 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  46.05 
 
 
659 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  43.36 
 
 
295 aa  176  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
273 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  44.21 
 
 
642 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 
650 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  46.67 
 
 
637 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  42.52 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  42.67 
 
 
671 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  43.56 
 
 
653 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  42.67 
 
 
701 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
290 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
244 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
262 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
261 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
264 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
266 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
244 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
265 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
257 aa  99  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.31 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
224 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
241 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
278 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
268 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
246 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  35.35 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
259 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  34.5 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
259 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  32.99 
 
 
301 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
256 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226851  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
264 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
266 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
251 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  33.96 
 
 
255 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
243 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
256 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.8 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
257 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  36.87 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09127  short-chain oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13950)  34.59 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.83 
 
 
259 aa  92.4  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
261 aa  92.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  35.68 
 
 
261 aa  92.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 
247 aa  92.4  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  35.18 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  33.5 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>