More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2507 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  55.74 
 
 
659 aa  756    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  59.1 
 
 
665 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  59.17 
 
 
671 aa  848    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  59.49 
 
 
664 aa  842    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  59.19 
 
 
668 aa  838    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  100 
 
 
661 aa  1368    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 
665 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 
671 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  43.49 
 
 
653 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  41.36 
 
 
637 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 
650 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  42.95 
 
 
701 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  41.17 
 
 
642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.14 
 
 
295 aa  310  6.999999999999999e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.54 
 
 
292 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  52.74 
 
 
295 aa  303  7.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  49.53 
 
 
341 aa  281  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  51.17 
 
 
294 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  49.06 
 
 
319 aa  243  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
305 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 
291 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 
291 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 
291 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  45.66 
 
 
294 aa  217  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 
291 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 
291 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 
291 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 
294 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
273 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
275 aa  180  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
280 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  29.84 
 
 
359 aa  163  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  29.86 
 
 
354 aa  163  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.89 
 
 
1270 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  30.41 
 
 
358 aa  150  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  30.24 
 
 
356 aa  147  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  29.06 
 
 
373 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
264 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.54 
 
 
248 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  25.83 
 
 
392 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  29.46 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
279 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  29.46 
 
 
383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  24.72 
 
 
1367 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
281 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
246 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
242 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
244 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.88 
 
 
252 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
242 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.98 
 
 
246 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
246 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
264 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
250 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  31.11 
 
 
505 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.05 
 
 
230 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.44 
 
 
937 aa  110  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 
264 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.98 
 
 
264 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 
264 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.98 
 
 
264 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  35.98 
 
 
264 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
251 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
342 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
258 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
260 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
317 aa  108  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 
347 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 
264 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
272 aa  107  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
245 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
251 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.39 
 
 
264 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
245 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 
588 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.96 
 
 
236 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  32.85 
 
 
301 aa  107  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 
2439 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 
588 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
267 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229091  hitchhiker  0.0024535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
280 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 
588 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
276 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
257 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
246 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
272 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
258 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
257 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
264 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
264 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
354 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  29.57 
 
 
267 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.27 
 
 
246 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
245 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
244 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  32 
 
 
292 aa  105  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0965776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>