More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 937 aa  1940    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 596 aa  245  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 600 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 599 aa  225  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 602 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 607 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.94 
 
 		 611 aa  219  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 612 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 607 aa  218  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 608 aa  218  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 602 aa  217  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 599 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 603 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 600 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 622 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.02 
 
 		 599 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 604 aa  211  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 603 aa  211  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 551 aa  210  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 551 aa  210  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  29.6 
 
 		 600 aa  210  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 633 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 606 aa  208  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 607 aa  208  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 604 aa  207  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 597 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 597 aa  207  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 555 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 597 aa  207  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 546 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 555 aa  206  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.8 
 
 		 597 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 601 aa  205  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 603 aa  205  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 599 aa  205  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.48 
 
 		 612 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.64 
 
 		 563 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.89 
 
 		 599 aa  204  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 591 aa  204  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.51 
 
 		 610 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 615 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 605 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 616 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.3 
 
 		 563 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 616 aa  202  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 609 aa  202  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 554 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 554 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 554 aa  202  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.61 
 
 		 602 aa  202  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.69 
 
 		 612 aa  201  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.92 
 
 		 606 aa  201  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 601 aa  201  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.15 
 
 		 610 aa  200  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 773 aa  200  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 598 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 606 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 610 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  28.65 
 
 		 554 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 551 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 595 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 601 aa  199  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 599 aa  198  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 601 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.26 
 
 		 587 aa  197  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.35 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 613 aa  197  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 596 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 600 aa  196  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  29.78 
 
 		 555 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 612 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 632 aa  195  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 554 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 554 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 554 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 609 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 554 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.07 
 
 		 563 aa  193  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 599 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  29.7 
 
 		 555 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 605 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 615 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 608 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 580 aa  191  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 605 aa  191  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 592 aa  191  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 		 555 aa  191  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.28 
 
 		 603 aa  191  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 547 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>