More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1519 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  72.46 
 
 		 610 aa  956    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  81.97 
 
 		 610 aa  1063    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  66.72 
 
 		 610 aa  881    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  68.85 
 
 		 609 aa  909    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  77.21 
 
 		 610 aa  1012    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 610 aa  1258    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  71.15 
 
 		 607 aa  924    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  43.59 
 
 		 633 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 		 603 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  40.98 
 
 		 603 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 592 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 633 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 596 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 605 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 591 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 		 598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  39.27 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 637 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 590 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 612 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  37.95 
 
 		 592 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 		 601 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 592 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 649 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 590 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 669 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 617 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 		 605 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 685 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 606 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 607 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 597 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 606 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 606 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 605 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 597 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.42 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  35.13 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 606 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 580 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 604 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.66 
 
 		 602 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 604 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 607 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 598 aa  369  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 598 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 603 aa  365  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 598 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  35.6 
 
 		 580 aa  365  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 660 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 		 598 aa  364  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 598 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 599 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  33.79 
 
 		 602 aa  363  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 622 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 605 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  33.97 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 606 aa  361  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 601 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 601 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 601 aa  359  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 601 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.44 
 
 		 599 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 597 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 601 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 599 aa  356  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 595 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  34.38 
 
 		 597 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 616 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.02 
 
 		 602 aa  355  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 602 aa  354  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 607 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 610 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 597 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 608 aa  353  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 593 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 597 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 602 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 599 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 601 aa  352  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 604 aa  349  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 630 aa  349  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 623 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 601 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  33.75 
 
 		 588 aa  347  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.52 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 602 aa  347  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>