More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1901 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  58.43 
 
 		 599 aa  683    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  63.94 
 
 		 600 aa  759    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  56.86 
 
 		 605 aa  680    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  58.96 
 
 		 608 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  60.9 
 
 		 606 aa  715    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  54.85 
 
 		 602 aa  642    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.37 
 
 		 597 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 606 aa  1208    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  63.42 
 
 		 606 aa  744    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  58.96 
 
 		 602 aa  656    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  59.97 
 
 		 606 aa  683    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  58.96 
 
 		 603 aa  687    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  58.37 
 
 		 622 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  59.17 
 
 		 604 aa  694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  59.7 
 
 		 599 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  55.73 
 
 		 602 aa  633  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  55.33 
 
 		 593 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  55.2 
 
 		 616 aa  626  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  54.47 
 
 		 619 aa  628  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  54.52 
 
 		 599 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  53.94 
 
 		 597 aa  621  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  54.98 
 
 		 599 aa  617  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  51.83 
 
 		 602 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  54.01 
 
 		 599 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  52.42 
 
 		 600 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  53.42 
 
 		 599 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  51.42 
 
 		 600 aa  601  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  51.91 
 
 		 601 aa  596  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  52.25 
 
 		 598 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  50.98 
 
 		 611 aa  591  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  51.81 
 
 		 615 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  50.91 
 
 		 604 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  51.68 
 
 		 595 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  52.76 
 
 		 599 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  50.57 
 
 		 609 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  50.57 
 
 		 609 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  49.24 
 
 		 607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  49.66 
 
 		 601 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  49.67 
 
 		 597 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 		 597 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  52.44 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  48.83 
 
 		 602 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  48.83 
 
 		 597 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  49 
 
 		 600 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  48.19 
 
 		 615 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  49.58 
 
 		 596 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  45.33 
 
 		 603 aa  521  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 612 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.55 
 
 		 606 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  48.82 
 
 		 632 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  44.76 
 
 		 618 aa  507  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  45.76 
 
 		 612 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  44.95 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  42.52 
 
 		 679 aa  465  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  40.53 
 
 		 701 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  39.8 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  44.89 
 
 		 590 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 622 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  40.31 
 
 		 677 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  40.13 
 
 		 649 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 605 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 607 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.8 
 
 		 604 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 		 604 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 609 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 607 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 617 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.95 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 606 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 610 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 606 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 606 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 598 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 590 aa  361  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 633 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 622 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.45 
 
 		 587 aa  349  8e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.73 
 
 		 610 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 633 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 612 aa  345  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 603 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 590 aa  343  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 610 aa  343  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 592 aa  343  8e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 592 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 596 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 597 aa  342  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 652 aa  339  8e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 635 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 669 aa  335  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  34.62 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 660 aa  333  4e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>