More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1560 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 637 aa  1314    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  40.51 
 
 		 633 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 610 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 610 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.52 
 
 		 610 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 610 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.44 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 603 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 603 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 590 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  35.02 
 
 		 587 aa  360  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 596 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 633 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 652 aa  337  3.9999999999999995e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 597 aa  337  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 597 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 592 aa  334  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 597 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  35.45 
 
 		 592 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 669 aa  332  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 601 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 601 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 601 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 597 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 590 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  33.17 
 
 		 568 aa  326  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 598 aa  326  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 604 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 604 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 599 aa  323  8e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 612 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 660 aa  320  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 605 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 604 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  31.5 
 
 		 611 aa  312  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.46 
 
 		 602 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  32.14 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 601 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.48 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 605 aa  306  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 595 aa  306  8.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 649 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 601 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 685 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 672 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.49 
 
 		 602 aa  300  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 592 aa  300  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 604 aa  299  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 605 aa  299  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.59 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 610 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 614 aa  298  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 599 aa  297  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 594 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 602 aa  296  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 607 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.38 
 
 		 606 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 620 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 591 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 606 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 612 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 606 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 606 aa  293  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 601 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 605 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 600 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 663 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 684 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 660 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 661 aa  287  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.65 
 
 		 602 aa  287  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  30.39 
 
 		 601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 599 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 602 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  31.53 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 645 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 607 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 609 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  30.34 
 
 		 580 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>