More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3794 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  53.31 
 
 		 611 aa  691    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.48 
 
 		 602 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  67.05 
 
 		 601 aa  830    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  67.05 
 
 		 601 aa  830    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.88 
 
 		 601 aa  690    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  73.79 
 
 		 601 aa  920    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  94.51 
 
 		 601 aa  1186    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  72.38 
 
 		 601 aa  893    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 601 aa  1250    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  54.3 
 
 		 602 aa  685    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  69.83 
 
 		 602 aa  871    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  68.8 
 
 		 588 aa  820    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  51.51 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  52.27 
 
 		 597 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  52.27 
 
 		 597 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  52.27 
 
 		 597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  51.17 
 
 		 601 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  51 
 
 		 601 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  51.17 
 
 		 601 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  51.34 
 
 		 601 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  52.85 
 
 		 568 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  47.09 
 
 		 599 aa  582  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  49.41 
 
 		 597 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  49.42 
 
 		 597 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  49.75 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  47.1 
 
 		 598 aa  571  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  49.16 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  47.48 
 
 		 598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  48.36 
 
 		 597 aa  535  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  40.57 
 
 		 633 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.38 
 
 		 607 aa  402  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 603 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 603 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.39 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 633 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 597 aa  359  9e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  36.25 
 
 		 587 aa  359  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 607 aa  356  7.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 612 aa  356  7.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 607 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 598 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 592 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.39 
 
 		 610 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 610 aa  352  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 606 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 617 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 610 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 606 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 606 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 609 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 622 aa  339  9e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 649 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 623 aa  336  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 610 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 612 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 590 aa  329  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 618 aa  329  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 607 aa  327  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 592 aa  326  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 596 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 626 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.43 
 
 		 606 aa  320  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 594 aa  319  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 604 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 605 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  32.51 
 
 		 592 aa  314  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 604 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 599 aa  313  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 599 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.98 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 637 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 590 aa  310  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 604 aa  310  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 597 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  33.98 
 
 		 600 aa  309  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 605 aa  309  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 601 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  32.01 
 
 		 603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 603 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  32.59 
 
 		 607 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.99 
 
 		 603 aa  303  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 602 aa  303  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 685 aa  302  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 616 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 608 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 610 aa  300  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 602 aa  300  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 600 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 602 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 602 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>