More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0377 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  60.33 
 
 
660 aa  782    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  78.33 
 
 
669 aa  1066    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  60.44 
 
 
685 aa  818    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  58.09 
 
 
660 aa  753    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  63.7 
 
 
672 aa  861    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
652 aa  1323    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  40.47 
 
 
592 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.68 
 
 
610 aa  398  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
609 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 
610 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 
610 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 
633 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 
610 aa  389  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
612 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  39.04 
 
 
606 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.61 
 
 
610 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
590 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  35.63 
 
 
587 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 
607 aa  369  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
596 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
603 aa  364  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 
603 aa  363  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 
599 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
630 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
600 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
598 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  35.8 
 
 
592 aa  353  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
597 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 
599 aa  351  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0164  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
658 aa  351  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 
633 aa  350  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
592 aa  350  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 
604 aa  349  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 
597 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.56 
 
 
599 aa  347  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
604 aa  346  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
603 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  37.33 
 
 
599 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
608 aa  345  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 
590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
622 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
599 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
605 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 
603 aa  337  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
604 aa  336  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
607 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
649 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.01 
 
 
602 aa  334  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
606 aa  333  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.03 
 
 
611 aa  333  7.000000000000001e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 
619 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
602 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
604 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
604 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
597 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 
597 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 
602 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
597 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
597 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
620 aa  330  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
594 aa  330  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 
593 aa  328  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
596 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
604 aa  327  4.0000000000000003e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 
616 aa  327  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
622 aa  327  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 
601 aa  325  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  32.66 
 
 
618 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  31.23 
 
 
603 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
600 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
615 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
606 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 
606 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
600 aa  320  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 
595 aa  319  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
602 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 
612 aa  318  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 
617 aa  317  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
606 aa  316  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.98 
 
 
598 aa  316  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 
606 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  35.61 
 
 
600 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 
626 aa  313  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
609 aa  312  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
612 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  31.26 
 
 
602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 
599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 
602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 
580 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  34.24 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 
632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>