More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3057 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  61.2 
 
 
602 aa  702    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  56.54 
 
 
601 aa  689    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  52.72 
 
 
663 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
605 aa  1231    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  61.42 
 
 
602 aa  761    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  55.52 
 
 
620 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  48.12 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 
616 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.27 
 
 
614 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  50.85 
 
 
509 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  45.48 
 
 
609 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  45.48 
 
 
609 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  44.43 
 
 
647 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 
612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 
633 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  37.98 
 
 
610 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
603 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 
607 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 
603 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.13 
 
 
610 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 
610 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
609 aa  362  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 
610 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
603 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
610 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 
597 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 
597 aa  346  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 
597 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  35.16 
 
 
568 aa  343  7e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
597 aa  342  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 
598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  34.73 
 
 
602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
601 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 
604 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
601 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
601 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
601 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 
597 aa  332  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
602 aa  330  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
598 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 
601 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
612 aa  324  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  34.77 
 
 
580 aa  323  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
580 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  33.85 
 
 
611 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
605 aa  321  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 
598 aa  320  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  33.56 
 
 
597 aa  320  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.99 
 
 
599 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 
592 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 
605 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
598 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
599 aa  316  9e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 
602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 
605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 
616 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
597 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
602 aa  312  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
597 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
597 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
597 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
598 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
601 aa  309  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 
604 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 
604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 
604 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 
600 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 
601 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 
630 aa  306  7e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
594 aa  306  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 
599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.44 
 
 
587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 
652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 
617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
590 aa  304  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
595 aa  303  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 
601 aa  303  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
596 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
601 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 
591 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
600 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
593 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 
669 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  33.04 
 
 
592 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
637 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
601 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  31.82 
 
 
601 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 
592 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 
599 aa  297  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
612 aa  297  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
596 aa  296  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 
612 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  32.17 
 
 
588 aa  296  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 
605 aa  294  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
626 aa  293  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 
601 aa  293  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  32.28 
 
 
679 aa  291  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
601 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.49 
 
 
598 aa  290  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>