More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 
602 aa  1218    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  56.26 
 
 
599 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  54.88 
 
 
619 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  57.86 
 
 
605 aa  664    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  54.15 
 
 
602 aa  634  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  55.44 
 
 
606 aa  628  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  53.85 
 
 
606 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  52.33 
 
 
603 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  54.85 
 
 
606 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  54.67 
 
 
606 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  53.91 
 
 
602 aa  616  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  53.85 
 
 
616 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  52.24 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  52.74 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  52.75 
 
 
599 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.18 
 
 
597 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  53.18 
 
 
599 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  52.59 
 
 
604 aa  608  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  52.68 
 
 
599 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  51.84 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  51.67 
 
 
599 aa  601  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  51.58 
 
 
599 aa  601  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  51 
 
 
595 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  50.16 
 
 
615 aa  588  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  50.25 
 
 
600 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  51.83 
 
 
593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  49.58 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  50.5 
 
 
597 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  49.67 
 
 
601 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
611 aa  570  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 
607 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  49.58 
 
 
598 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  49.83 
 
 
599 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  51.18 
 
 
622 aa  561  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 
597 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  48.09 
 
 
601 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 
597 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 
597 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  49.67 
 
 
609 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  48.66 
 
 
591 aa  551  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  47.83 
 
 
602 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  47.5 
 
 
600 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  48.59 
 
 
604 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  47.25 
 
 
597 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  46.92 
 
 
597 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  44.8 
 
 
618 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  48.32 
 
 
609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  49.38 
 
 
615 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  46.73 
 
 
612 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  46.7 
 
 
607 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  44.3 
 
 
603 aa  504  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  45.59 
 
 
596 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  45.3 
 
 
606 aa  488  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  46.25 
 
 
632 aa  482  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 
612 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  41.54 
 
 
679 aa  465  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  41.37 
 
 
682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  43.85 
 
 
677 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  40.03 
 
 
701 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 
605 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 
604 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 
622 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 
604 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 
604 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  42.98 
 
 
590 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
594 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 
617 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 
622 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
607 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 
602 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 
609 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
607 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 
603 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
597 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
610 aa  355  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
610 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
606 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
603 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
606 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 
649 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
606 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 
610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 
590 aa  343  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 
612 aa  343  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
613 aa  343  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 
598 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.25 
 
 
610 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.33 
 
 
610 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 
607 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 
652 aa  334  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
602 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
602 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
602 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
635 aa  329  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 
592 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
603 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 
612 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
660 aa  325  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>