More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2941 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 773 aa  1562    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  46.92 
 
 		 610 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  45.67 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11582  fatty-acid-CoA ligase fadD11  49.43 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 		 616 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 		 613 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 		 612 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 608 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 601 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.64 
 
 		 612 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 597 aa  333  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 624 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 626 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 604 aa  314  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 623 aa  312  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 607 aa  310  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.27 
 
 		 599 aa  302  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 602 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 633 aa  299  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 597 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 597 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 592 aa  296  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 597 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 606 aa  295  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.58 
 
 		 610 aa  294  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 594 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 601 aa  293  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 603 aa  293  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 610 aa  293  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 609 aa  292  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 615 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 602 aa  292  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.42 
 
 		 602 aa  291  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 616 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 603 aa  290  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 606 aa  290  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.25 
 
 		 610 aa  290  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 601 aa  289  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 622 aa  290  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 615 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 595 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 607 aa  287  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  34.04 
 
 		 600 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 606 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.83 
 
 		 597 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 610 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 		 602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 602 aa  283  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 606 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 599 aa  283  9e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.51 
 
 		 606 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 608 aa  282  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 591 aa  281  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 602 aa  281  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.25 
 
 		 587 aa  280  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 598 aa  280  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 610 aa  280  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 605 aa  279  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 606 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 606 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 607 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  31.76 
 
 		 618 aa  278  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  32.1 
 
 		 603 aa  278  4e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 612 aa  276  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  32.27 
 
 		 679 aa  275  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 597 aa  273  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 617 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 603 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 604 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 599 aa  271  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 601 aa  271  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 600 aa  271  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 612 aa  270  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 597 aa  270  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 609 aa  270  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  32.24 
 
 		 611 aa  270  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  32.81 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 619 aa  269  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 603 aa  267  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 605 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 599 aa  267  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 604 aa  267  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 602 aa  266  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 601 aa  266  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 597 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 649 aa  266  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 600 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>