More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1953 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  74.26 
 
 		 612 aa  915    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  61.89 
 
 		 616 aa  763    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 613 aa  1231    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  52.53 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  45.62 
 
 		 612 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  45.38 
 
 		 624 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 		 597 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  45.91 
 
 		 607 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  45.12 
 
 		 601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  42.19 
 
 		 610 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 		 773 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11582  fatty-acid-CoA ligase fadD11  44.08 
 
 		 571 aa  364  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 603 aa  359  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 603 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 618 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 		 617 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 626 aa  344  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 602 aa  343  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 607 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 606 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 623 aa  343  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 		 622 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 606 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 597 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 633 aa  339  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 606 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 649 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 596 aa  336  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 594 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.18 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 610 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 603 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 600 aa  331  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 604 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 602 aa  326  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.17 
 
 		 597 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 601 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 616 aa  324  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 597 aa  324  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 615 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 653 aa  323  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 609 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 605 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.53 
 
 		 602 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 592 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 599 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 615 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 611 aa  320  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 599 aa  319  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 590 aa  319  9e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.93 
 
 		 606 aa  319  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 604 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 603 aa  317  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 606 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 604 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.91 
 
 		 599 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 607 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 600 aa  312  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 622 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 613 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.18 
 
 		 610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.06 
 
 		 602 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 591 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  33.67 
 
 		 600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 610 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 651 aa  308  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 596 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 606 aa  306  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 610 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 608 aa  306  9.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 632 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 612 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.2 
 
 		 602 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 610 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.4 
 
 		 598 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 633 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 606 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  33.09 
 
 		 592 aa  301  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 593 aa  301  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 600 aa  300  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.5 
 
 		 611 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.21 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 596 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 597 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  32.42 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>