More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1750 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  100 
 
 		 642 aa  1302    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  55.47 
 
 		 701 aa  653    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  48.75 
 
 		 637 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 		 653 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 671 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  49.37 
 
 		 650 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  45.62 
 
 		 665 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  43.26 
 
 		 659 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  41.17 
 
 		 661 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  39.88 
 
 		 668 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  40.03 
 
 		 665 aa  439  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 671 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 664 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 305 aa  231  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 292 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 295 aa  217  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  42.7 
 
 		 295 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  44.85 
 
 		 341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 294 aa  177  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 291 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 291 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 291 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  35.77 
 
 		 359 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 319 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  44.21 
 
 		 294 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 294 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  35 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 		 275 aa  150  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  33.79 
 
 		 358 aa  150  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 291 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 291 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 291 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  31.02 
 
 		 354 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 273 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  31.42 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 280 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  27.17 
 
 		 1270 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  30.4 
 
 		 392 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  35.53 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  35.16 
 
 		 383 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 937 aa  114  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 264 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  35.11 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.78 
 
 		 238 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  35.46 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  31.64 
 
 		 351 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 267 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.36 
 
 		 265 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 258 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 342 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 505 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 257 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 242 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 242 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  29.96 
 
 		 264 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 290 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  31.72 
 
 		 410 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.96 
 
 		 264 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.77 
 
 		 264 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.96 
 
 		 264 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.77 
 
 		 264 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.77 
 
 		 264 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 		 247 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 		 292 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.85 
 
 		 248 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 260 aa  100  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.55 
 
 		 264 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.63 
 
 		 246 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  30.3 
 
 		 276 aa  98.2  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 261 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 241 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 264 aa  97.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 272 aa  97.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 		 239 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 		 239 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 		 239 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 		 239 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  32.86 
 
 		 437 aa  96.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  27.99 
 
 		 301 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.62 
 
 		 238 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 339 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.01 
 
 		 242 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.01 
 
 		 242 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.01 
 
 		 242 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.01 
 
 		 242 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 264 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.01 
 
 		 242 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 281 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 280 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 		 269 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.01 
 
 		 239 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 		 262 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.09 
 
 		 264 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  30.99 
 
 		 506 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 		 239 aa  95.1  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 272 aa  94.7  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 266 aa  94.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 		 276 aa  94.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>