More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0732 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  72.76 
 
 		 294 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  73.1 
 
 		 319 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  67.7 
 
 		 294 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  61.59 
 
 		 294 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  61.37 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  61.37 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  61.01 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 		 661 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 		 292 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 		 671 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 664 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 		 665 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  44.83 
 
 		 668 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 665 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  44.96 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  45.38 
 
 		 659 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  44.66 
 
 		 341 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 		 650 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  44.89 
 
 		 671 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  44.89 
 
 		 653 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  47.74 
 
 		 637 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  40.53 
 
 		 642 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  40.32 
 
 		 701 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  33.49 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  36.53 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  36.53 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 		 249 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.17 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  33.67 
 
 		 265 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  38.69 
 
 		 256 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  37.64 
 
 		 252 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.23 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 241 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  40.72 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.75 
 
 		 544 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  36.92 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  34.17 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.56 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  31.71 
 
 		 1270 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 		 251 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  33.85 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 245 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 		 244 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 231 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 231 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  30.77 
 
 		 263 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 247 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>