More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13425 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 650 aa  1298    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  70.92 
 
 		 671 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  73.7 
 
 		 653 aa  909    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  52.88 
 
 		 637 aa  614  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  49.05 
 
 		 642 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  45.4 
 
 		 659 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  47.43 
 
 		 701 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 		 665 aa  505  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 		 661 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 668 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 665 aa  415  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  38.73 
 
 		 664 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  38.47 
 
 		 671 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 		 305 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 292 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 295 aa  231  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  42.38 
 
 		 295 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  39.25 
 
 		 341 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 		 294 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 319 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 		 291 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 		 291 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 		 291 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 		 275 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 294 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 294 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 291 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 273 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 		 280 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  33.61 
 
 		 356 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 264 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  29.09 
 
 		 354 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  31.93 
 
 		 359 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.1 
 
 		 248 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 267 aa  117  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  31.61 
 
 		 381 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 383 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  33.73 
 
 		 301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  31.32 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  31.44 
 
 		 373 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 261 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  27.27 
 
 		 1270 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 272 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 242 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 242 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 258 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 264 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  35.42 
 
 		 261 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 		 246 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 266 aa  105  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.16 
 
 		 236 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 		 251 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 		 252 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 261 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 262 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 330 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 241 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 		 336 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 		 284 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 252 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.59 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 260 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 		 336 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 269 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 267 aa  102  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 		 246 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 267 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 267 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 		 244 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 269 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.22 
 
 		 238 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 267 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 293 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 276 aa  101  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 		 292 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 		 244 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 267 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 344 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 246 aa  100  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 267 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 272 aa  100  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.97 
 
 		 264 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 255 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.97 
 
 		 264 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 280 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 261 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 277 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 272 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  31 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 247 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 276 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 245 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 267 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>