More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1232 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  52.61 
 
 		 659 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  54.96 
 
 		 665 aa  271  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  53.56 
 
 		 671 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  50.57 
 
 		 637 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  49.43 
 
 		 650 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  50.38 
 
 		 661 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  51.31 
 
 		 653 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  47.71 
 
 		 665 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 		 668 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  47.53 
 
 		 664 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  44.85 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  46.92 
 
 		 671 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  47.23 
 
 		 642 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  51.6 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  48.18 
 
 		 701 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  46.79 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  45.2 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  45.2 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 264 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  38.95 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 244 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.82 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 257 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 340 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  33.8 
 
 		 242 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  33.8 
 
 		 242 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 258 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  37.42 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.42 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.04 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.42 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.42 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.42 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.42 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.5 
 
 		 245 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 239 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 246 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 246 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.72 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  33.14 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  36.97 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.42 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 241 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>