More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4728 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  53.63 
 
 
358 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  46.48 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  46.37 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  41.83 
 
 
373 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  40.17 
 
 
381 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.17 
 
 
383 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  39.89 
 
 
383 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
661 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  32.4 
 
 
637 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 
671 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 
671 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 
664 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  29.16 
 
 
665 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  37.43 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
653 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  31.47 
 
 
659 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  31.69 
 
 
392 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  34.92 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 
665 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  28.88 
 
 
668 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  31.02 
 
 
642 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  31.13 
 
 
701 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  29.09 
 
 
650 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.55 
 
 
937 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  36.6 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  33.22 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  38.91 
 
 
354 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  31.03 
 
 
493 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  30.4 
 
 
505 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  29.56 
 
 
1498 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  30.21 
 
 
351 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  27.68 
 
 
506 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  27.8 
 
 
523 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  28.67 
 
 
2439 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 
1444 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  30.58 
 
 
1395 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26.59 
 
 
2374 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  27.69 
 
 
685 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  29.18 
 
 
1454 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  24.1 
 
 
618 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  24.15 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  26.59 
 
 
2376 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  22.92 
 
 
618 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  25.07 
 
 
1077 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  29.19 
 
 
2107 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  23.19 
 
 
618 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  23.21 
 
 
618 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  24.46 
 
 
618 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  29.83 
 
 
667 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  25.32 
 
 
1067 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  29.51 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  24.16 
 
 
627 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  24.16 
 
 
627 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  22.59 
 
 
617 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  22.59 
 
 
618 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  31.87 
 
 
1506 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  27.68 
 
 
2113 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  28.93 
 
 
1188 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  28.93 
 
 
1188 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.18 
 
 
1270 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  27.6 
 
 
1413 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  28.93 
 
 
1188 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  30.18 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  27.76 
 
 
1449 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  26.48 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.19 
 
 
1500 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  26.48 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  27.18 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  26.9 
 
 
1485 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  28.21 
 
 
1436 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
1406 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  24.49 
 
 
1193 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  24.38 
 
 
1193 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  25.87 
 
 
1162 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2109  nonribosomal peptide synthetase  26.82 
 
 
1145 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  24.66 
 
 
1194 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  26.03 
 
 
2512 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.48 
 
 
809 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  24.66 
 
 
1487 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.33 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  23.53 
 
 
997 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  25.89 
 
 
1174 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  25.89 
 
 
1174 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  28.35 
 
 
2054 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  25.57 
 
 
1174 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  24.74 
 
 
1168 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.08 
 
 
357 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5011  amino acid adenylation:thioester reductase  25.51 
 
 
1148 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  22.8 
 
 
991 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.61 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  25.25 
 
 
1149 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  27.49 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  24.67 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  23.62 
 
 
4580 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  23.99 
 
 
4048 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  23.62 
 
 
4101 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>