More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3229 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  100 
 
 		 351 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  39.41 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.52 
 
 		 937 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  33.64 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  33.47 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  34.58 
 
 		 437 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  29.5 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  28.37 
 
 		 506 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  30.55 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  34.06 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 671 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  31.56 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  29.09 
 
 		 1454 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  28.88 
 
 		 661 aa  86.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  28.93 
 
 		 1413 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  31 
 
 		 701 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  29.58 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  29.27 
 
 		 637 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  25.19 
 
 		 664 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  29.63 
 
 		 991 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  27.4 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  30.11 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  27.4 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  31.37 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  24.72 
 
 		 665 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  27.54 
 
 		 671 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  29.2 
 
 		 659 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  25.1 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  34.98 
 
 		 1436 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  33.61 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 2376 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  28.4 
 
 		 1506 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  25.1 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 		 992 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  28.2 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  27.48 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  27.59 
 
 		 1193 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 2374 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  27.91 
 
 		 1394 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  31.75 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  31.75 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  29.74 
 
 		 667 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  28.36 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.93 
 
 		 1270 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  27.2 
 
 		 1193 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  28.33 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  28.93 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  29.85 
 
 		 2512 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  26.67 
 
 		 1067 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 665 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  24.22 
 
 		 1194 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  25.59 
 
 		 2439 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  28.21 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  27.27 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  27.31 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.92 
 
 		 1500 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  24.04 
 
 		 523 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  27.27 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  30.14 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  29.68 
 
 		 1449 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  27.99 
 
 		 1485 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  29.54 
 
 		 2107 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  30.45 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  28.51 
 
 		 1367 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  27.84 
 
 		 1409 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  28.14 
 
 		 1498 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  26.67 
 
 		 997 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.82 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  26.97 
 
 		 995 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  22.98 
 
 		 618 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  23.08 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  26.69 
 
 		 1421 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  26.82 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  27.82 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  26.69 
 
 		 4048 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  27.24 
 
 		 1002 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0110  NADH dehydrogenase  29.73 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  22.98 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  22.98 
 
 		 618 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  28.29 
 
 		 2199 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  26.92 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.8 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>