173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2515 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  99.73 
 
 		 369 aa  767    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  98.64 
 
 		 369 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  69.11 
 
 		 374 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  62.87 
 
 		 369 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  56.64 
 
 		 369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  46.88 
 
 		 385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  45.8 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  38.07 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  38.1 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  36.73 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  35.25 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  34.78 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.78 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.78 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.51 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.51 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.51 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  30.5 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  30.5 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  30.5 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  30.24 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  30.29 
 
 		 403 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  32.45 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  27.75 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 		 937 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  28.57 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  24.33 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  28.73 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  26.84 
 
 		 1454 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  26.87 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  27.57 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4168  Male sterility domain  33.33 
 
 		 764 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  23.33 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  26.8 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  27.34 
 
 		 1270 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  28.73 
 
 		 1485 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  27.5 
 
 		 1413 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.18 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  24.8 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05348  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0521089  normal  0.0191103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.08 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  26.14 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  24.05 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.17 
 
 		 1500 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 2374 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  23.61 
 
 		 650 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  27.73 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04827  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  28.32 
 
 		 1051 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  23.94 
 
 		 618 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  23.77 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  23.94 
 
 		 664 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  26.48 
 
 		 2199 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  29.69 
 
 		 1560 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 1406 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  23.67 
 
 		 2376 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  23.94 
 
 		 627 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  23.94 
 
 		 627 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  25.35 
 
 		 618 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  25.2 
 
 		 701 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  24.51 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  30.77 
 
 		 2512 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  25.78 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  25.81 
 
 		 642 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 505 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  23.94 
 
 		 618 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  25.27 
 
 		 506 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  24.63 
 
 		 2439 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  25.28 
 
 		 1506 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  25.9 
 
 		 1409 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  24.41 
 
 		 618 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  22.19 
 
 		 1421 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  23.47 
 
 		 618 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  28.23 
 
 		 1436 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  26.58 
 
 		 1480 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  23.28 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14531  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  26.26 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.699739  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  24.8 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  23.51 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  24.8 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  26.14 
 
 		 1449 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  26.94 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 319 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  25.87 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>