More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3013 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  737    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  96.72 
 
 
366 aa  712    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  45.87 
 
 
351 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  38.7 
 
 
373 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  30.71 
 
 
493 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.88 
 
 
937 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  35.98 
 
 
359 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.79 
 
 
383 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  35.44 
 
 
381 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  35.09 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  32.8 
 
 
358 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  35.56 
 
 
356 aa  115  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  31.88 
 
 
410 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  36.08 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  33.22 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  33.07 
 
 
437 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  36.25 
 
 
354 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 
671 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  37.5 
 
 
701 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  35.46 
 
 
642 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  32.51 
 
 
659 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  33.19 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 
653 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  26.81 
 
 
505 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  28.68 
 
 
1394 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  26.69 
 
 
2439 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  30.71 
 
 
1449 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  32.38 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  25.86 
 
 
398 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  25.86 
 
 
398 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  31.02 
 
 
1454 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  28.67 
 
 
392 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  34.94 
 
 
1436 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  31.65 
 
 
637 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 
665 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  28.07 
 
 
1067 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  29.01 
 
 
1506 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  28.8 
 
 
506 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  30.35 
 
 
2107 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  29.55 
 
 
1485 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  26.69 
 
 
1421 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  32.26 
 
 
1395 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 
668 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
671 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  27.1 
 
 
2376 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26.07 
 
 
2374 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.28 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  27.4 
 
 
664 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.91 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  27.45 
 
 
1367 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  27.83 
 
 
1413 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  29.33 
 
 
1500 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
665 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  25.45 
 
 
661 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
650 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1225  peptide synthetase  26.36 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  26.74 
 
 
1270 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  24.65 
 
 
685 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  25.42 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  31.37 
 
 
1188 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  31.37 
 
 
1188 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  28.96 
 
 
1188 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  30.33 
 
 
1165 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  28.33 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  28.74 
 
 
1498 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 
1406 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 
1444 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  35.76 
 
 
1537 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  28.81 
 
 
1149 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  26.83 
 
 
667 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.16 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  24.33 
 
 
997 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
1542 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.31 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  30.14 
 
 
1105 aa  69.7  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  22.88 
 
 
618 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  27.63 
 
 
991 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  25.1 
 
 
1409 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
1538 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  31.49 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
1538 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  22.95 
 
 
618 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  22.44 
 
 
618 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  28.33 
 
 
353 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  30.83 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.16 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  23.23 
 
 
618 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  23.1 
 
 
618 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  23.23 
 
 
617 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  27.54 
 
 
1480 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  30.65 
 
 
4123 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  22.77 
 
 
618 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  30.65 
 
 
4157 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>