More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1165 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  100 
 
 
1537 aa  3009    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  76.78 
 
 
1557 aa  2151    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  96.29 
 
 
1538 aa  2724    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  46.01 
 
 
1542 aa  1257    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  95.97 
 
 
1538 aa  2704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
824 aa  380  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  33.49 
 
 
824 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 
918 aa  359  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  33.1 
 
 
824 aa  348  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  33.18 
 
 
825 aa  343  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  33.3 
 
 
825 aa  341  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  32.83 
 
 
811 aa  335  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 
812 aa  335  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 
903 aa  311  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
887 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 
819 aa  299  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 
854 aa  278  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  25.18 
 
 
826 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
570 aa  275  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  24.85 
 
 
829 aa  274  9e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.5 
 
 
575 aa  269  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
572 aa  266  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
576 aa  260  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  33.39 
 
 
564 aa  257  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 
607 aa  255  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
610 aa  254  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
605 aa  251  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.37 
 
 
610 aa  251  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
609 aa  250  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 
610 aa  249  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.36 
 
 
610 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
606 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
562 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
610 aa  244  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
620 aa  243  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 
604 aa  241  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
490 aa  241  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 
605 aa  240  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
604 aa  239  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
604 aa  239  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 
633 aa  239  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 
564 aa  238  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
605 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
492 aa  235  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.38 
 
 
510 aa  232  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  34.75 
 
 
624 aa  230  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
592 aa  225  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  30.02 
 
 
551 aa  225  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  33.15 
 
 
580 aa  224  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
580 aa  224  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
603 aa  224  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.48 
 
 
602 aa  223  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
505 aa  219  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 
591 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
604 aa  218  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 
637 aa  218  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
601 aa  216  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
539 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 
602 aa  214  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 
603 aa  214  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 
579 aa  211  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
620 aa  211  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 
612 aa  210  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.37 
 
 
514 aa  210  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 
599 aa  208  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.57 
 
 
555 aa  208  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
549 aa  207  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
603 aa  207  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 
612 aa  206  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
509 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
592 aa  206  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.52 
 
 
592 aa  205  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
520 aa  205  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
598 aa  205  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
579 aa  205  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 
605 aa  205  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 
590 aa  204  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  33.94 
 
 
510 aa  204  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.9 
 
 
556 aa  204  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  33.94 
 
 
510 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.23 
 
 
516 aa  203  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
599 aa  203  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 
592 aa  203  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
501 aa  202  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
525 aa  202  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.9 
 
 
491 aa  202  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.53 
 
 
587 aa  202  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
511 aa  201  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
663 aa  201  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 
508 aa  202  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  29.91 
 
 
503 aa  201  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
605 aa  201  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.59 
 
 
614 aa  201  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
503 aa  201  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
599 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
518 aa  201  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.86 
 
 
598 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 
507 aa  200  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 
519 aa  200  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
495 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>