More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1469 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 605 aa  1230    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  58.47 
 
 		 620 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  51.61 
 
 		 624 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 607 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.16 
 
 		 610 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 572 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 603 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 633 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 610 aa  263  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  32.31 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 603 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 605 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 633 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 609 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 610 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.7 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 562 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 1542 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 553 aa  251  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 607 aa  250  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  37.95 
 
 		 1537 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 824 aa  249  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 1538 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 564 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 1538 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 592 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 603 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  31.04 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.14 
 
 		 587 aa  241  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  28.57 
 
 		 592 aa  240  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 592 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 580 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 812 aa  233  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  37.15 
 
 		 824 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.09 
 
 		 575 aa  230  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  36.39 
 
 		 1557 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 		 606 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 592 aa  226  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 		 614 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 615 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 596 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 		 619 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.93 
 
 		 599 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 918 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 819 aa  223  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 602 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 522 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  36.29 
 
 		 824 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 825 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 607 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 663 aa  217  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 604 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 598 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 604 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 604 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 601 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 825 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 602 aa  212  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 567 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 746 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 		 594 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 602 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 649 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  36.07 
 
 		 811 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 601 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 630 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 652 aa  207  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 606 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 606 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 508 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 610 aa  207  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 606 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 590 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 684 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 600 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.32 
 
 		 555 aa  204  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 633 aa  203  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 		 626 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 605 aa  203  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 591 aa  203  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 599 aa  203  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.65 
 
 		 557 aa  202  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 597 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 887 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 		 660 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 649 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 603 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  35.57 
 
 		 551 aa  201  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 685 aa  200  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>