More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3746 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  47.95 
 
 
826 aa  738    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  48.13 
 
 
829 aa  761    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
819 aa  1649    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 
812 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 
824 aa  542  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 
918 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 
903 aa  334  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 
1557 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  27.62 
 
 
811 aa  294  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  27.27 
 
 
1537 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
1538 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 
887 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 
1538 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  27.16 
 
 
824 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  26.61 
 
 
824 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 
825 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 
825 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 
854 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.66 
 
 
575 aa  226  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 
605 aa  224  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
598 aa  223  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 
610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  35.2 
 
 
624 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.1 
 
 
610 aa  219  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
610 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
599 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 
633 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
604 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.04 
 
 
598 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.51 
 
 
610 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 
1542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
606 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 
607 aa  214  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 
610 aa  211  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 
605 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.56 
 
 
587 aa  210  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.12 
 
 
557 aa  209  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 
602 aa  208  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
562 aa  208  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 
576 aa  208  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
612 aa  207  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 
620 aa  207  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
603 aa  207  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  30.91 
 
 
611 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  30.33 
 
 
564 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 
633 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 
602 aa  205  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
603 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
599 aa  204  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
602 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
602 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  29.9 
 
 
580 aa  204  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
612 aa  204  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 
658 aa  203  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 
604 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
580 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
596 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
609 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 
604 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 
632 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
592 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 
600 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 
572 aa  201  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
599 aa  201  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 
601 aa  200  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  27.46 
 
 
601 aa  200  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  27.25 
 
 
588 aa  200  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 
602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 
607 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.62 
 
 
592 aa  199  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.76 
 
 
601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  32.41 
 
 
551 aa  198  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 
597 aa  198  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 
601 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
570 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.25 
 
 
602 aa  197  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
602 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.67 
 
 
599 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 
593 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 
599 aa  197  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 
597 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1232  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.47 
 
 
402 aa  195  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
639 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
639 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
597 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
620 aa  196  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
597 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
603 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
619 aa  195  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 
613 aa  195  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.3 
 
 
597 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 
652 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 
601 aa  194  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 
660 aa  194  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 
610 aa  194  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
649 aa  193  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.28 
 
 
602 aa  193  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
637 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>