More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3483 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  53.13 
 
 		 624 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  58.47 
 
 		 605 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 620 aa  1273    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 576 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 572 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 603 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 603 aa  270  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  31.4 
 
 		 564 aa  261  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 1542 aa  261  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 607 aa  260  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 564 aa  260  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 610 aa  257  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 562 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 610 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 610 aa  249  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 918 aa  246  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 592 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 824 aa  246  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  34.89 
 
 		 1537 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 633 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 1538 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 1538 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 606 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 812 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 1557 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  37.2 
 
 		 592 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.49 
 
 		 610 aa  226  8e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 663 aa  226  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 609 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.05 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.81 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.54 
 
 		 614 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  36.41 
 
 		 824 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 825 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 825 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 609 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 607 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 590 aa  217  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 522 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  35.1 
 
 		 824 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  37.1 
 
 		 580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 652 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 637 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 611 aa  211  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 672 aa  211  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  35.56 
 
 		 811 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 605 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 605 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 620 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 604 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 612 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 604 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 599 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 604 aa  207  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 819 aa  207  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 604 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 602 aa  207  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 633 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  26.55 
 
 		 602 aa  206  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.59 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 649 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 669 aa  203  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.13 
 
 		 602 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  27.62 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 602 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 647 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 649 aa  200  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 590 aa  199  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.62 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 591 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.19 
 
 		 603 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 826 aa  197  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 606 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 660 aa  197  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 660 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 626 aa  197  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.87 
 
 		 555 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.76 
 
 		 602 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 583 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 600 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 		 603 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 685 aa  194  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>