More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2858 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
918 aa  1884    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
824 aa  433  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
812 aa  398  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 
819 aa  357  6.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 
1542 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  29.3 
 
 
1537 aa  349  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
1557 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 
1538 aa  344  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
1538 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
903 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 
826 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
887 aa  304  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  27.15 
 
 
824 aa  296  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  27.95 
 
 
824 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  28.15 
 
 
811 aa  290  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 
825 aa  274  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  25.76 
 
 
829 aa  272  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 
825 aa  270  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.79 
 
 
575 aa  264  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 
620 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 
572 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 
854 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 
576 aa  228  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.68 
 
 
610 aa  227  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
610 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
610 aa  225  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  32.78 
 
 
624 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
605 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
592 aa  223  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 
570 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
638 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
597 aa  219  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
605 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.97 
 
 
610 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 
661 aa  217  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 
606 aa  218  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  31.06 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 
633 aa  214  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 
658 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  30.06 
 
 
568 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
639 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
639 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
597 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 
609 aa  212  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 
597 aa  211  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 
597 aa  211  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
522 aa  210  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
492 aa  208  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
603 aa  208  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
601 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
601 aa  207  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
604 aa  207  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
601 aa  207  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
601 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 
604 aa  207  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 
610 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
604 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 
512 aa  204  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
508 aa  204  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
598 aa  204  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 
637 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 
521 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.03 
 
 
508 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  28.81 
 
 
515 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
603 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
605 aa  197  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 
562 aa  197  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 
612 aa  197  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
564 aa  197  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.31 
 
 
649 aa  196  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 
684 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 
657 aa  195  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.21 
 
 
513 aa  194  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 
490 aa  194  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
633 aa  194  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 
601 aa  194  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
495 aa  194  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 
521 aa  193  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
511 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 
662 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 
519 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
525 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
553 aa  190  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 
498 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 
594 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
602 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 
685 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.83 
 
 
580 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
520 aa  188  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
608 aa  187  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 
580 aa  187  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 
597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.64 
 
 
510 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.64 
 
 
510 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.64 
 
 
510 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.64 
 
 
510 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 
606 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>