More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0193 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  75.36 
 
 		 562 aa  894    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  100 
 
 		 564 aa  1152    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  72.16 
 
 		 564 aa  856    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  45.02 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  38.18 
 
 		 557 aa  330  5.0000000000000004e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 553 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 570 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 610 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 607 aa  263  6.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 576 aa  262  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 592 aa  262  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 620 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.1 
 
 		 610 aa  260  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.16 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 633 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.59 
 
 		 1537 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 1538 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 1538 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 633 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 606 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 610 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 603 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 610 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  29.68 
 
 		 624 aa  240  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 887 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 903 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  35.04 
 
 		 811 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 1542 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 605 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 605 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 604 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 604 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 604 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 603 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 812 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.42 
 
 		 603 aa  228  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 612 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 824 aa  226  8e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.14 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 602 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 605 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  31.99 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 603 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  32.84 
 
 		 824 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 580 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 599 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 825 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.13 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 		 1557 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 632 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 630 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 918 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 825 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 612 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 663 aa  213  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 595 aa  213  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.61 
 
 		 587 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 520 aa  211  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 607 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 652 aa  211  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  30.4 
 
 		 824 aa  210  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.49 
 
 		 599 aa  209  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.32 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.75 
 
 		 592 aa  208  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 591 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 620 aa  207  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 599 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 819 aa  206  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 658 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  29.68 
 
 		 602 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.28 
 
 		 602 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 638 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 599 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 598 aa  203  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.7 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.68 
 
 		 601 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 592 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 639 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 625 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 639 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 660 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 607 aa  200  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.23 
 
 		 597 aa  200  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 630 aa  199  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 602 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 647 aa  199  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  30.42 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 669 aa  198  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 601 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>