More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0054 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 625 aa  1275    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 658 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 684 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  37.77 
 
 		 649 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 657 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 661 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 639 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 639 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 638 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.81 
 
 		 664 aa  363  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  33.49 
 
 		 630 aa  362  8e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 629 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 629 aa  357  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.17 
 
 		 645 aa  356  7.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.22 
 
 		 621 aa  349  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.56 
 
 		 637 aa  345  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 641 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.53 
 
 		 647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 		 647 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.8 
 
 		 657 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 		 657 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.75 
 
 		 647 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  31.37 
 
 		 641 aa  321  3e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  34.09 
 
 		 645 aa  320  5e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.24 
 
 		 630 aa  306  6e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.22 
 
 		 610 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 610 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 607 aa  294  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 610 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.01 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 610 aa  280  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 630 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 603 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  31.12 
 
 		 633 aa  272  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 612 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 669 aa  270  7e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 603 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 602 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 620 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 660 aa  260  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 606 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  30.55 
 
 		 603 aa  258  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 605 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 592 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 672 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 604 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.81 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 633 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 604 aa  248  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.63 
 
 		 592 aa  241  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.43 
 
 		 602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 598 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 		 614 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 595 aa  240  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 594 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 596 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 622 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 663 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.54 
 
 		 602 aa  239  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 		 591 aa  237  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.91 
 
 		 608 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 593 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 612 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 590 aa  233  9e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 599 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 637 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.74 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 601 aa  230  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 685 aa  230  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.06 
 
 		 606 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 599 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 609 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.52 
 
 		 606 aa  227  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 619 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 		 606 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 		 660 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 601 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 597 aa  224  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 604 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 607 aa  223  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 599 aa  223  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 604 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 649 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 606 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 603 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 602 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 645 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 615 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>