More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0042 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 630 aa  1298    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  62.72 
 
 		 629 aa  801    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  53.61 
 
 		 629 aa  714    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 658 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  35.79 
 
 		 641 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  33.49 
 
 		 625 aa  362  8e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 		 639 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 		 639 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 661 aa  349  8e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 638 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.94 
 
 		 647 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.4 
 
 		 647 aa  340  5e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.07 
 
 		 647 aa  339  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.55 
 
 		 641 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 684 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.3 
 
 		 645 aa  333  6e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.12 
 
 		 664 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  33.01 
 
 		 645 aa  328  2.0000000000000001e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.68 
 
 		 637 aa  320  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.21 
 
 		 630 aa  319  9e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  34.97 
 
 		 649 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.17 
 
 		 657 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.11 
 
 		 657 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.61 
 
 		 621 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 607 aa  296  8e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 657 aa  296  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 633 aa  286  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 612 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.75 
 
 		 610 aa  283  9e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 603 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 603 aa  280  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 603 aa  277  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  30.59 
 
 		 633 aa  266  8.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 610 aa  263  8e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 609 aa  262  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 669 aa  262  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 652 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.13 
 
 		 606 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.55 
 
 		 602 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 608 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 612 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.89 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 597 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 		 602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 		 597 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  31.43 
 
 		 600 aa  243  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 620 aa  243  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 590 aa  243  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 590 aa  242  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 592 aa  240  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 609 aa  239  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 622 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 596 aa  237  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 632 aa  236  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 605 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 685 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  28.16 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 602 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.37 
 
 		 587 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  28.59 
 
 		 599 aa  234  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.19 
 
 		 599 aa  234  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 660 aa  234  5e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 602 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 604 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 637 aa  233  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 605 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 599 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 663 aa  232  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.33 
 
 		 599 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  28.51 
 
 		 618 aa  231  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 604 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.28 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 604 aa  231  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.05 
 
 		 602 aa  230  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 615 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 599 aa  230  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 607 aa  229  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.25 
 
 		 602 aa  229  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 601 aa  229  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 633 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 647 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 597 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 597 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 597 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 604 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 602 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 597 aa  227  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 604 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>