More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1737 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.61 
 
 
664 aa  838    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
657 aa  1344    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.63 
 
 
645 aa  760    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.59 
 
 
637 aa  764    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.39 
 
 
647 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.77 
 
 
647 aa  641    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 
641 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  96.04 
 
 
657 aa  1291    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.29 
 
 
621 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.77 
 
 
647 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  43.32 
 
 
649 aa  511  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  42.92 
 
 
684 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 
657 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 
658 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 
639 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 
639 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 
638 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  41.17 
 
 
661 aa  465  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  35.76 
 
 
633 aa  337  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
625 aa  335  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 
630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 
629 aa  294  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
633 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
607 aa  289  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.35 
 
 
610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.16 
 
 
645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 
609 aa  283  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
629 aa  283  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  33.17 
 
 
641 aa  282  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.05 
 
 
610 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
610 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
610 aa  278  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 
603 aa  271  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
610 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  31.52 
 
 
630 aa  268  2.9999999999999995e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
603 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
652 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 
633 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
630 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
660 aa  246  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
592 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 
669 aa  244  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
612 aa  244  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 
672 aa  243  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 
605 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 
663 aa  243  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
637 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 
590 aa  241  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 
509 aa  237  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 
604 aa  236  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
599 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
592 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.78 
 
 
597 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.98 
 
 
602 aa  233  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.68 
 
 
587 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
604 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 
685 aa  230  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
604 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 
620 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 
605 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 
604 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 
608 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 
602 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
599 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 
645 aa  225  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
605 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  29.24 
 
 
603 aa  223  6e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.72 
 
 
592 aa  223  8e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
597 aa  223  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 
604 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
605 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 
598 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 
601 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 
609 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
603 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 
601 aa  220  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 
598 aa  220  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
590 aa  220  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 
601 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.93 
 
 
614 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 
598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 
601 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
580 aa  217  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.3 
 
 
602 aa  217  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.34 
 
 
601 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.94 
 
 
606 aa  216  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 
599 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 
609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  29.83 
 
 
580 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  25.29 
 
 
602 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 
606 aa  214  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  26.23 
 
 
597 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 
602 aa  213  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 
601 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  29.37 
 
 
702 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
599 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 
605 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 
602 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
632 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>