More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01120 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 606 aa  1237    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 597 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  52.14 
 
 		 600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.52 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  50.53 
 
 		 601 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  50.68 
 
 		 605 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  49.4 
 
 		 616 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  52.42 
 
 		 599 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  51.44 
 
 		 599 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.67 
 
 		 606 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  48.38 
 
 		 599 aa  531  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  46.69 
 
 		 602 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  47.06 
 
 		 611 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  46.8 
 
 		 600 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48 
 
 		 599 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  47.29 
 
 		 607 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  47.9 
 
 		 602 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  49.3 
 
 		 606 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  46.96 
 
 		 608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  47.63 
 
 		 603 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  48.67 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  49.07 
 
 		 593 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  45.84 
 
 		 598 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  48.62 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  48.22 
 
 		 600 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  44.78 
 
 		 615 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  49.39 
 
 		 597 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  46.09 
 
 		 622 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  48.55 
 
 		 606 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.07 
 
 		 599 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  45.91 
 
 		 604 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 		 602 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  46.11 
 
 		 599 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  47.64 
 
 		 591 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 609 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  47.94 
 
 		 606 aa  497  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  47.41 
 
 		 612 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  47.14 
 
 		 599 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  46.26 
 
 		 602 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  45.39 
 
 		 596 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  45.04 
 
 		 602 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  45.69 
 
 		 615 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  46.06 
 
 		 600 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 619 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  45.22 
 
 		 597 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  44.98 
 
 		 632 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  43.74 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  43.79 
 
 		 609 aa  452  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  41.37 
 
 		 679 aa  429  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  41.4 
 
 		 612 aa  428  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  40.18 
 
 		 603 aa  417  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  38.42 
 
 		 618 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  40.17 
 
 		 607 aa  402  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  37.62 
 
 		 677 aa  398  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  38.38 
 
 		 682 aa  395  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 701 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 606 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 612 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 617 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 622 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 605 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 613 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 		 622 aa  353  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 604 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 606 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 604 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 606 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 649 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 607 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 604 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 607 aa  343  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 602 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 602 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 602 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  34.84 
 
 		 592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 609 aa  336  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.79 
 
 		 610 aa  333  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 597 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 633 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 635 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 603 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 660 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 610 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 590 aa  320  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 603 aa  319  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 610 aa  317  6e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 652 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 610 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 592 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>