More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1388 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
602 aa  1231    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 
605 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.46 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
604 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 
604 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 
616 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 
599 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
607 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 
600 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
599 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
599 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 
597 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
597 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 
615 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 
597 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 
602 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 
601 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 
606 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 
601 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 
600 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 
612 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.56 
 
 
607 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 
599 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 
605 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 
606 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 
600 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  37.61 
 
 
611 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  37.95 
 
 
600 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
615 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 
595 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
604 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.03 
 
 
599 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  39.18 
 
 
606 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 
622 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 
607 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
603 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.19 
 
 
597 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 
597 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
619 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
602 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
594 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
606 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 
622 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
591 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 
606 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 
649 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
604 aa  365  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
602 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 
603 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.3 
 
 
602 aa  362  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 
593 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 
602 aa  360  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
617 aa  359  9e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
606 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  37.33 
 
 
606 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
616 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
603 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
599 aa  353  5e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
597 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 
612 aa  353  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
597 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
613 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 
596 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.93 
 
 
598 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
618 aa  348  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
623 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
610 aa  346  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
608 aa  343  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  34.94 
 
 
618 aa  343  7e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 
609 aa  342  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 
592 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 
607 aa  342  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
609 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
626 aa  342  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
632 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  36.21 
 
 
607 aa  340  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
602 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
603 aa  340  5.9999999999999996e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  35.9 
 
 
603 aa  339  9.999999999999999e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
602 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
602 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
609 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 
597 aa  337  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
633 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
612 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
610 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
610 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.18 
 
 
606 aa  333  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 
607 aa  332  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
596 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 
612 aa  332  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 
610 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.94 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
613 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 
608 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  34.35 
 
 
677 aa  322  8e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.22 
 
 
610 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 
610 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 
601 aa  317  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>