More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0660 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  72.58 
 
 		 621 aa  893    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.63 
 
 		 657 aa  768    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 645 aa  1301    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  79.22 
 
 		 637 aa  1026    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.1 
 
 		 657 aa  778    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.5 
 
 		 664 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.17 
 
 		 647 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.17 
 
 		 647 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.39 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.8 
 
 		 641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  43.83 
 
 		 684 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  44.5 
 
 		 639 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  44.5 
 
 		 639 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  42.66 
 
 		 658 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  44.07 
 
 		 649 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 657 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 		 661 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  42.92 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 625 aa  364  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 		 630 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  34.63 
 
 		 633 aa  319  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.72 
 
 		 645 aa  306  7e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 633 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 609 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.89 
 
 		 610 aa  300  7e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.27 
 
 		 610 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 629 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  31.5 
 
 		 641 aa  286  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.76 
 
 		 630 aa  278  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 610 aa  277  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 610 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 652 aa  266  8.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 630 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 669 aa  263  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 637 aa  259  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 		 597 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 663 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 592 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 620 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 603 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 672 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 604 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 604 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 612 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 685 aa  240  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 591 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 592 aa  240  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 598 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 609 aa  238  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.21 
 
 		 614 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 603 aa  238  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.71 
 
 		 587 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 608 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 509 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 609 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 601 aa  233  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 604 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  32.81 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.55 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 602 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.02 
 
 		 599 aa  230  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 599 aa  230  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 607 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 591 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 597 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 597 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 604 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 603 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 597 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 597 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 598 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.03 
 
 		 611 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 598 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 601 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 601 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 607 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 615 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.18 
 
 		 602 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 597 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  28.15 
 
 		 611 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 647 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 645 aa  223  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 660 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 773 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.42 
 
 		 599 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 601 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>