More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0606 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  100 
 
 
645 aa  1288    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  39.29 
 
 
641 aa  459  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  37.83 
 
 
630 aa  399  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
639 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
639 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  33.49 
 
 
658 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
684 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  33.18 
 
 
661 aa  349  9e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
638 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 
629 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 
657 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 
630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.07 
 
 
664 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
625 aa  326  9e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
647 aa  323  7e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 
629 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 
647 aa  317  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.9 
 
 
649 aa  316  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.88 
 
 
645 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.99 
 
 
621 aa  308  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 
647 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 
641 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 
607 aa  303  7.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 
637 aa  299  8e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.39 
 
 
657 aa  297  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 
603 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.78 
 
 
610 aa  294  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
603 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 
609 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
633 aa  293  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 
603 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 
657 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.01 
 
 
610 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
610 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 
669 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 
596 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
672 aa  284  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  33.11 
 
 
592 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
610 aa  281  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
652 aa  280  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 
685 aa  273  9e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 
660 aa  270  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
610 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.82 
 
 
587 aa  267  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
592 aa  263  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
601 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
598 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 
630 aa  258  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 
637 aa  257  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
660 aa  257  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 
601 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 
592 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 
633 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
599 aa  253  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 
607 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
590 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 
612 aa  253  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
601 aa  251  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
601 aa  250  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  29.81 
 
 
601 aa  250  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 
590 aa  250  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  31.39 
 
 
633 aa  249  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.38 
 
 
602 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
601 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.97 
 
 
602 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
605 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  30.59 
 
 
588 aa  247  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  28.36 
 
 
611 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
602 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 
626 aa  243  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.04 
 
 
606 aa  243  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.64 
 
 
601 aa  243  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
599 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 
592 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
604 aa  242  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.76 
 
 
603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 
663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 
600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 
620 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.84 
 
 
602 aa  240  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  29.85 
 
 
597 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 
597 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 
651 aa  239  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
598 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 
598 aa  238  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 
610 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 
591 aa  237  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
601 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 
646 aa  237  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
597 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  29.02 
 
 
600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
597 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 
649 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 
649 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.61 
 
 
599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 
599 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.95 
 
 
597 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
604 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>