More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1457 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  53.61 
 
 		 630 aa  714    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  57.46 
 
 		 629 aa  756    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 629 aa  1298    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 658 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 625 aa  357  5e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 661 aa  347  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  32.19 
 
 		 641 aa  339  8e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.48 
 
 		 645 aa  334  3e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 639 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 639 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.61 
 
 		 641 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.11 
 
 		 647 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.94 
 
 		 647 aa  317  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 638 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 684 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.43 
 
 		 647 aa  313  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.21 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.51 
 
 		 645 aa  310  5e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.93 
 
 		 649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 657 aa  307  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.55 
 
 		 621 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.78 
 
 		 664 aa  303  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 657 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 592 aa  294  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.07 
 
 		 637 aa  294  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 633 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 652 aa  262  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 603 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 607 aa  257  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 612 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.59 
 
 		 610 aa  252  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.41 
 
 		 610 aa  250  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 592 aa  249  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 610 aa  249  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 609 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  28.97 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.96 
 
 		 602 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 603 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 603 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.29 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.08 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 633 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  26.47 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.21 
 
 		 606 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 597 aa  238  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 669 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 599 aa  237  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 622 aa  237  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  27.07 
 
 		 618 aa  236  8e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.86 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 605 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 597 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  28.12 
 
 		 592 aa  234  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.26 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 592 aa  233  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 596 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 609 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 609 aa  230  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 606 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 607 aa  229  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 601 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 		 685 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 604 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 604 aa  225  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  29.37 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 599 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 602 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 601 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.06 
 
 		 602 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 605 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 601 aa  223  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  26.48 
 
 		 601 aa  223  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 630 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  27.06 
 
 		 601 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 597 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  25.72 
 
 		 616 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 597 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  26.91 
 
 		 597 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 601 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 602 aa  220  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 599 aa  220  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 598 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 607 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  26.5 
 
 		 588 aa  219  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 649 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 604 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.73 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 604 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 615 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 619 aa  218  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 604 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 637 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>