More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1690 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  57.46 
 
 		 629 aa  773    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 629 aa  1288    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  62.72 
 
 		 630 aa  816    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 625 aa  363  4e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 658 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 661 aa  341  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 639 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 639 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  33.66 
 
 		 641 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 638 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  33.17 
 
 		 645 aa  325  1e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 		 641 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.23 
 
 		 647 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.71 
 
 		 647 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 684 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.23 
 
 		 647 aa  316  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.71 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.84 
 
 		 664 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 		 637 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  33.1 
 
 		 649 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 657 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 592 aa  293  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 645 aa  290  6e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 621 aa  286  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 657 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.14 
 
 		 657 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 603 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 607 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 612 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 633 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 603 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  32.23 
 
 		 633 aa  275  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 609 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 603 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.19 
 
 		 610 aa  266  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 610 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 605 aa  254  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 597 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 597 aa  250  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.78 
 
 		 610 aa  249  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 590 aa  246  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 669 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 620 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 606 aa  243  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 604 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 604 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 599 aa  236  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 604 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 608 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 604 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 612 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 596 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 622 aa  232  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  28.59 
 
 		 597 aa  231  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 602 aa  230  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 590 aa  230  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 660 aa  230  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 599 aa  230  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 663 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.97 
 
 		 599 aa  228  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 605 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.89 
 
 		 602 aa  226  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 		 597 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 601 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 609 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 619 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 601 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 598 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 672 aa  224  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 606 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 602 aa  224  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.29 
 
 		 602 aa  223  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 599 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.37 
 
 		 602 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 		 702 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 647 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 607 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  30.72 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 601 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 601 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 		 614 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 601 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.5 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 599 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 685 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 609 aa  219  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 602 aa  219  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  27.57 
 
 		 587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>