More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0095 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 663 aa  1353    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  52.72 
 
 		 605 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  51.78 
 
 		 620 aa  623  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  50.72 
 
 		 601 aa  598  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  50.4 
 
 		 602 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  49.11 
 
 		 602 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  44.64 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  44.87 
 
 		 616 aa  515  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.71 
 
 		 614 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  48.64 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 		 647 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  44.16 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  44.32 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 612 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 607 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.8 
 
 		 610 aa  349  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 633 aa  347  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 592 aa  343  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 597 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 597 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 612 aa  339  9e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.78 
 
 		 610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  33.55 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  33.5 
 
 		 568 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 610 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 609 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 598 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 601 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 603 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 601 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 610 aa  328  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 601 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 601 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 610 aa  325  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.32 
 
 		 602 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 603 aa  320  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  30.78 
 
 		 602 aa  317  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 597 aa  317  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 597 aa  317  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 603 aa  316  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31 
 
 		 601 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  30.55 
 
 		 611 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 580 aa  309  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  34.23 
 
 		 580 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  32.08 
 
 		 601 aa  308  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 601 aa  308  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 599 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  31.81 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 669 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 599 aa  304  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 594 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 604 aa  303  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 604 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 601 aa  303  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 602 aa  301  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 601 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 616 aa  298  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 630 aa  298  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 652 aa  297  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 601 aa  293  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 605 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 602 aa  290  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 601 aa  290  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 637 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 607 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 597 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 672 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 601 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.77 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 600 aa  283  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 612 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 633 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.13 
 
 		 592 aa  278  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 596 aa  277  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 602 aa  277  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.4 
 
 		 603 aa  276  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 685 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 597 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 602 aa  275  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 599 aa  274  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 		 591 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 610 aa  272  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 593 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 622 aa  271  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 612 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>