More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0918 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  59.27 
 
 		 661 aa  778    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  59.38 
 
 		 658 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  61.79 
 
 		 684 aa  793    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  100 
 
 		 649 aa  1313    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  56.61 
 
 		 638 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  56.16 
 
 		 657 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  54.95 
 
 		 639 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  54.95 
 
 		 639 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.32 
 
 		 657 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.35 
 
 		 621 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.46 
 
 		 657 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.07 
 
 		 645 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.83 
 
 		 664 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.01 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.82 
 
 		 647 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.67 
 
 		 647 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.52 
 
 		 647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.29 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 625 aa  409  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  37.4 
 
 		 633 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  32.26 
 
 		 641 aa  320  6e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 633 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.57 
 
 		 645 aa  309  1.0000000000000001e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 609 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.78 
 
 		 610 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 630 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  29.97 
 
 		 630 aa  296  1e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 629 aa  293  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.82 
 
 		 610 aa  284  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 610 aa  279  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 592 aa  277  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 612 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 607 aa  274  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 603 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 672 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 598 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 652 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 669 aa  267  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 633 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 603 aa  266  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 637 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 620 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  31.93 
 
 		 597 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 		 597 aa  260  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 596 aa  260  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 604 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 604 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  29.53 
 
 		 568 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 660 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 597 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 590 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 602 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 597 aa  253  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 604 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 598 aa  253  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 601 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 660 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.29 
 
 		 587 aa  251  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 601 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 601 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 601 aa  250  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 601 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 601 aa  249  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 604 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 602 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 599 aa  248  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 632 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 685 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 663 aa  246  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.85 
 
 		 602 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  28.31 
 
 		 611 aa  243  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 601 aa  243  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 606 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 591 aa  243  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 616 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 605 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.77 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 598 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 594 aa  241  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 598 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 597 aa  241  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 600 aa  240  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.13 
 
 		 599 aa  239  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 593 aa  239  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 602 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 622 aa  238  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>