More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1006 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  100 
 
 		 811 aa  1612    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  36.77 
 
 		 824 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 825 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  36.76 
 
 		 824 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 825 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 854 aa  363  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 824 aa  356  7.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 1538 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 1538 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 1557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  32.21 
 
 		 1537 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 819 aa  301  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 903 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 918 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 887 aa  269  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 1542 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  26.29 
 
 		 826 aa  258  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  32.82 
 
 		 564 aa  243  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  24.97 
 
 		 829 aa  242  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 603 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 564 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 610 aa  237  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.29 
 
 		 610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 572 aa  233  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 610 aa  232  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 603 aa  228  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 603 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.47 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 609 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  33.49 
 
 		 624 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 580 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  34.43 
 
 		 580 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 525 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 520 aa  218  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.35 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 620 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 576 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 		 514 aa  215  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 606 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 610 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 598 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 490 aa  211  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 602 aa  211  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 553 aa  208  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 633 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  31.61 
 
 		 551 aa  207  7e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 620 aa  206  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 597 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 597 aa  205  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 600 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 597 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 604 aa  204  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  24.61 
 
 		 570 aa  202  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  29.17 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 509 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 612 aa  201  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 604 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 608 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 662 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 596 aa  198  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 533 aa  198  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 598 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 645 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 495 aa  197  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.43 
 
 		 599 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.59 
 
 		 491 aa  196  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 583 aa  194  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 605 aa  194  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 632 aa  194  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 612 aa  194  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 601 aa  193  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 585 aa  193  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 595 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 498 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 		 619 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 601 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 602 aa  192  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 616 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.43 
 
 		 515 aa  191  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 592 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 609 aa  191  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.97 
 
 		 512 aa  191  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.98 
 
 		 587 aa  191  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 605 aa  190  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>