More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1369 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 572 aa  1170    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  56.99 
 
 		 576 aa  653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  49.39 
 
 		 570 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 606 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 620 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 609 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 610 aa  273  6e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  39.53 
 
 		 624 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 607 aa  266  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 		 824 aa  263  6.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 610 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  32.03 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.43 
 
 		 1537 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 1538 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 1538 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.86 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.91 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 1557 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 553 aa  249  9e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 812 aa  249  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 1542 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 562 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 918 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.63 
 
 		 575 aa  239  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 564 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 633 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 		 601 aa  233  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 612 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 603 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.25 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 605 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.45 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 592 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 603 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 607 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 887 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 590 aa  220  6e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 591 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  27.16 
 
 		 811 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 605 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 601 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.72 
 
 		 587 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 604 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 903 aa  204  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  35.19 
 
 		 824 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  29.25 
 
 		 551 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 663 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 819 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  25.08 
 
 		 669 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.49 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 604 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 652 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 607 aa  198  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 660 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 604 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 825 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  33.59 
 
 		 824 aa  196  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 637 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 580 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 604 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 620 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 607 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  25.5 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 825 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 609 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 599 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 592 aa  191  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.11 
 
 		 614 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 647 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  27.26 
 
 		 702 aa  186  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  25.76 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 672 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 595 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 606 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 645 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 615 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  25.67 
 
 		 649 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  26.66 
 
 		 630 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 596 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 		 632 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 		 597 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 606 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 826 aa  181  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 605 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>