More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2243 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 562 aa  1145    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  75.36 
 
 		 564 aa  894    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  79.18 
 
 		 564 aa  917    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  43.32 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  38.54 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 607 aa  259  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 610 aa  257  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.28 
 
 		 610 aa  256  9e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 570 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 620 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 633 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.23 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 592 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 572 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 1542 aa  243  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 612 aa  243  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  33.96 
 
 		 1537 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 903 aa  238  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  34.35 
 
 		 811 aa  236  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 633 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 887 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 610 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.12 
 
 		 603 aa  233  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 603 aa  230  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 605 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 825 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 824 aa  226  6e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  32.96 
 
 		 824 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.82 
 
 		 575 aa  224  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 812 aa  224  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 606 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 825 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  31.9 
 
 		 824 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.67 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 604 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 605 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 604 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 604 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  34.63 
 
 		 624 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 602 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 620 aa  210  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 1557 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 599 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 819 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 625 aa  207  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 630 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 630 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 605 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 1538 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 1538 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 591 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 603 aa  203  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  30.67 
 
 		 607 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  28.15 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.73 
 
 		 592 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  32.12 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  28.1 
 
 		 588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  29.43 
 
 		 602 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 610 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 663 aa  200  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 608 aa  199  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.31 
 
 		 598 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 669 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.73 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.15 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 632 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.84 
 
 		 601 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 597 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 509 aa  198  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.4 
 
 		 602 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 918 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.23 
 
 		 597 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 607 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 598 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 598 aa  196  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 647 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 597 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 660 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 605 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 601 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 598 aa  194  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 606 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>