More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0406 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  71.48 
 
 		 610 aa  909    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  72.07 
 
 		 603 aa  872    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  69.21 
 
 		 601 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  71.03 
 
 		 611 aa  877    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 609 aa  1244    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 		 618 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 649 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 607 aa  458  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 649 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 		 626 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 633 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 646 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 631 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 651 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  37.04 
 
 		 630 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.54 
 
 		 630 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 630 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 643 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 657 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 652 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  35.81 
 
 		 656 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.9 
 
 		 642 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 		 645 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 643 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 653 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 658 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 654 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  34.52 
 
 		 653 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 654 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 596 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 651 aa  359  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 648 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 661 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 648 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 642 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.83 
 
 		 650 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 653 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 682 aa  353  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 644 aa  353  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 648 aa  350  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 650 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  33.5 
 
 		 656 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 603 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 603 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 642 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 655 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 657 aa  343  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 643 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 648 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 648 aa  340  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 636 aa  340  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 661 aa  339  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 654 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 655 aa  337  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 655 aa  335  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 648 aa  333  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 616 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 613 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 659 aa  322  9.000000000000001e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 604 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 592 aa  320  6e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 604 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 606 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 634 aa  317  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 633 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 606 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 606 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 597 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.82 
 
 		 602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.1 
 
 		 602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 649 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 602 aa  307  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 599 aa  306  6e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 612 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 601 aa  306  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.13 
 
 		 601 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 595 aa  302  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 602 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  31.79 
 
 		 611 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.23 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 605 aa  298  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 608 aa  298  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  31.61 
 
 		 618 aa  296  6e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 601 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 600 aa  296  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 600 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.93 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>