More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0787 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  60.47 
 
 
655 aa  806    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  62.19 
 
 
644 aa  842    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  63.64 
 
 
652 aa  838    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  52.91 
 
 
659 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  52.98 
 
 
653 aa  680    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  59.94 
 
 
651 aa  788    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  52.66 
 
 
657 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  76.39 
 
 
648 aa  1039    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  77.31 
 
 
648 aa  1055    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  63.12 
 
 
645 aa  844    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  59.59 
 
 
661 aa  793    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  63.41 
 
 
654 aa  805    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  52.64 
 
 
661 aa  688    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  53.91 
 
 
653 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  75.93 
 
 
648 aa  1016    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  54.09 
 
 
656 aa  687    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  54.37 
 
 
658 aa  697    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
648 aa  1318    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  80.86 
 
 
648 aa  1080    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  62.19 
 
 
682 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  59.81 
 
 
654 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  53.13 
 
 
653 aa  683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  46.21 
 
 
649 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  45.11 
 
 
649 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  44.08 
 
 
647 aa  544  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 
633 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 
646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 
651 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 
648 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 
631 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 
643 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  40.03 
 
 
650 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  40.53 
 
 
643 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  41.38 
 
 
657 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  39.82 
 
 
642 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
643 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 
642 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 
655 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
642 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 
650 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
654 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  36.68 
 
 
656 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 
655 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
655 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  35.91 
 
 
630 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.33 
 
 
630 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
630 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 
636 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
634 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
609 aa  362  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 
607 aa  362  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 
611 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 
610 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
603 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
601 aa  330  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
618 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
626 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
623 aa  316  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
610 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
616 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
594 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 
633 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
606 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
604 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 
604 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 
606 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 
606 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
601 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 
599 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
622 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
601 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 
633 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  27.63 
 
 
611 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
604 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
592 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 
601 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 
617 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
601 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 
607 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 
612 aa  251  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.01 
 
 
610 aa  249  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
601 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 
603 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  28.52 
 
 
601 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 
613 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.14 
 
 
602 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 
649 aa  247  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  26.93 
 
 
607 aa  246  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  28.52 
 
 
588 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  27.39 
 
 
602 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 
610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6512  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 
635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 
610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 
607 aa  244  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
597 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
597 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
597 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.83 
 
 
601 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 
610 aa  241  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>