More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2282 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  51.35 
 
 		 649 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  53.02 
 
 		 633 aa  653    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  54.01 
 
 		 647 aa  668    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  52.37 
 
 		 649 aa  663    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 631 aa  1296    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  49.12 
 
 		 651 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  49.84 
 
 		 646 aa  624  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  46.04 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  46.04 
 
 		 643 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  46.53 
 
 		 655 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  45.01 
 
 		 650 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  45.64 
 
 		 642 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  46.04 
 
 		 643 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  45.32 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.22 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 657 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  44.39 
 
 		 643 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  42.14 
 
 		 654 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 		 655 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 		 655 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  41.56 
 
 		 656 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  40.82 
 
 		 656 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 655 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 661 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 		 648 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 648 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 658 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  39.94 
 
 		 630 aa  490  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  40.13 
 
 		 653 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  39.94 
 
 		 630 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 		 654 aa  492  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  39.4 
 
 		 653 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  40.13 
 
 		 653 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  39.03 
 
 		 648 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 652 aa  485  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  39.14 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 644 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 682 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 648 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 		 645 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  41.83 
 
 		 636 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 		 654 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 661 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 		 659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 634 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 		 648 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 		 648 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  39.71 
 
 		 651 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 		 657 aa  458  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 607 aa  432  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 610 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 603 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 626 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 		 603 aa  326  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 603 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 604 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 605 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 604 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 604 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 617 aa  292  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 603 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 596 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.09 
 
 		 610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 607 aa  283  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 616 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.27 
 
 		 587 aa  273  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 622 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 609 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 606 aa  270  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 649 aa  269  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6512  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 635 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 612 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 606 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4907  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 635 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3256  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 635 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 590 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.05 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 602 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.97 
 
 		 602 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 613 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 607 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.62 
 
 		 601 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 605 aa  253  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  29.66 
 
 		 611 aa  252  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>