More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1569 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  100 
 
 		 510 aa  1028    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.18 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.18 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.18 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.94 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.18 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.33 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.14 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.14 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.94 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.68 
 
 		 514 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.99 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.02 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  41.44 
 
 		 521 aa  364  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.94 
 
 		 512 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 		 511 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  41.26 
 
 		 512 aa  359  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  42.41 
 
 		 508 aa  346  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 		 559 aa  343  5.999999999999999e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 		 521 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  43.87 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 		 507 aa  339  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 539 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 		 511 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 		 662 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 527 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  36.14 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  39.84 
 
 		 515 aa  326  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 557 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40 
 
 		 516 aa  318  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 543 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 		 506 aa  316  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 566 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 		 501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 584 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 561 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.51 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 582 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 561 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 561 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 498 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 561 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 583 aa  309  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 506 aa  309  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 518 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 520 aa  307  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 549 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 		 506 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 582 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 563 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.84 
 
 		 563 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 549 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 544 aa  302  9e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.35 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.4 
 
 		 500 aa  299  8e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 553 aa  299  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 569 aa  299  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 578 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0411  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 513 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.89 
 
 		 585 aa  296  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.2 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 564 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.65 
 
 		 517 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.65 
 
 		 517 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.65 
 
 		 517 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>