More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1067 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  100 
 
 		 685 aa  1439    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  38.1 
 
 		 410 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  27.7 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  35.75 
 
 		 437 aa  98.6  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  30.92 
 
 		 354 aa  96.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2590  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 397 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  27.69 
 
 		 354 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  29.18 
 
 		 359 aa  88.6  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2609  Alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 403 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.194987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  27.62 
 
 		 664 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  27.84 
 
 		 659 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  25.34 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  30.65 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  32.06 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  26.39 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  26.13 
 
 		 668 aa  76.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  32.5 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.89 
 
 		 937 aa  75.5  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  27.81 
 
 		 1454 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  33.02 
 
 		 2107 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 2374 aa  74.7  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  24.65 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  25.3 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  28.64 
 
 		 2439 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  27.43 
 
 		 1421 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  24.19 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  27.37 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  27.72 
 
 		 383 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  29.33 
 
 		 1500 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  30.1 
 
 		 1413 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  29.41 
 
 		 1480 aa  71.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  25.35 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  26.41 
 
 		 4098 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  26.41 
 
 		 4580 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  26.41 
 
 		 4101 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  26.41 
 
 		 4123 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  26.41 
 
 		 4157 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  26.41 
 
 		 4122 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  26.64 
 
 		 2199 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  31.25 
 
 		 2054 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.72 
 
 		 809 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  30.05 
 
 		 1478 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  28.33 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  28.33 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  25.97 
 
 		 4048 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  28.64 
 
 		 1485 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 2376 aa  68.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  31.21 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 1406 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  28.79 
 
 		 1194 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1432  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.7 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.438652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  24.83 
 
 		 1498 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 333 aa  63.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  25.36 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.92 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  25.64 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  31.98 
 
 		 750 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  25.61 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  26.8 
 
 		 1105 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  29.81 
 
 		 1188 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  25.67 
 
 		 2638 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  29.81 
 
 		 1188 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  29.81 
 
 		 1188 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  30.16 
 
 		 1077 aa  60.8  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08412  hybrid PKS-NRPS (Eurofung)  28.25 
 
 		 3930 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  27.39 
 
 		 1409 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.02 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  28.8 
 
 		 1193 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  26.07 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6052  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  26.83 
 
 		 1067 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  30.48 
 
 		 1436 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.71 
 
 		 338 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.24 
 
 		 331 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  25.61 
 
 		 1394 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  24.32 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.71 
 
 		 338 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5822  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 		 286 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 338 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  27.23 
 
 		 1193 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 309 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00540  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  26.92 
 
 		 1048 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 		 330 aa  56.2  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  25.46 
 
 		 2512 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2220  hypothetical protein  23.94 
 
 		 513 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 355 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  28.92 
 
 		 1506 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.03 
 
 		 338 aa  55.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.5 
 
 		 342 aa  55.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  24.14 
 
 		 329 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 1542 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 272 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.67 
 
 		 375 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  24.76 
 
 		 320 aa  54.7  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 319 aa  54.7  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  30.41 
 
 		 1367 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>