21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5822 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5822  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6052  alpha/beta hydrolase fold  97.55 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1571  hypothetical protein  41.88 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1653  hypothetical protein  41.88 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.57291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1230  hypothetical protein  41.09 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2590  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2609  Alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.194987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4708  coronamic acid synthetase CmaE  24.62 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  21.94 
 
 		 685 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  28.09 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  21.53 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  26.17 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.45 
 
 		 219 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1163  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  25.76 
 
 		 7149 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>