More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1163 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1163  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2791  alpha/beta hydrolase fold  48.39 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5083  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.501475  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5171  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5461  diacylglycerol O-acyltransferase  46.25 
 
 		 753 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  36.71 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  29.79 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  29.36 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  28.62 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.9 
 
 		 393 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.44 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.85 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.85 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.74 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  31.65 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  33.19 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.13 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.93 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.67 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.48 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  31.51 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.36 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  28.22 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.13 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  26.91 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.1 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  29.54 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  27.47 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  26.14 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  25.89 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  25.48 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.17 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.4 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.18 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.14 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.7 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  30.17 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  24.32 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>