More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2308 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
283 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  58.94 
 
 
277 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 
265 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  39.31 
 
 
264 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
280 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
266 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
265 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  34.21 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 
263 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
262 aa  161  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 
237 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
263 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
265 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  35.06 
 
 
263 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.17 
 
 
263 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
263 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
255 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.61 
 
 
248 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  32.92 
 
 
259 aa  135  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
271 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  31.44 
 
 
261 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
254 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.79 
 
 
262 aa  122  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.74 
 
 
282 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
279 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.29 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.19 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.7 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
300 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
273 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.5 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
231 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.84 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
270 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 
392 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  31.2 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
279 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
267 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
264 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.69 
 
 
425 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
235 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 
261 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
271 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.73 
 
 
263 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 
260 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
245 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
278 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
276 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.65 
 
 
270 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 
261 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 
261 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.24 
 
 
368 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.08 
 
 
262 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
271 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 
269 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
248 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
275 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  27.46 
 
 
262 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
260 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.13 
 
 
256 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
266 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.95 
 
 
271 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.06 
 
 
265 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.31 
 
 
368 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.81 
 
 
261 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.31 
 
 
368 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  27.95 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 
261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 
261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 
261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.89 
 
 
266 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  29.32 
 
 
275 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.56 
 
 
274 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
277 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  23.83 
 
 
259 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  28.96 
 
 
328 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
260 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  27.69 
 
 
269 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
258 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>