More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1353 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 339 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  45.48 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  42.44 
 
 		 345 aa  228  9e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  36.86 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  36.95 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  33.12 
 
 		 312 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.86 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.86 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  30.31 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  29.79 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.32 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.08 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.43 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.52 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 289 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.01 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  29.41 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.09 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.55 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 456 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.1 
 
 		 562 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 276 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 258 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 273 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.21 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 258 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  29.41 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.28 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.28 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>